2021年7月12日下午，来自中国农业科学院深圳农业基因组研究所的张兴坦研究员在蚕学宫一楼报告厅进行了一场题为Implication of haplotype-resolved genome assembly in plants的精彩学术报告。
报告的主要内容是：人类及许多动植物等物种都是二倍体，其存在两套染色体，一套来自于父本，一套来自于母本。传统的二倍体基因组组装只筛选出一套染色体作为代表，形成参考基因组。然后该策略忽视了同源染色体之间的大量遗传变异。为了最大程度还原个体的遗传信息，我们团队开发了一系列方法（如ALLHiC），成功实现了高杂合二倍体茶树基因组、榕树X和Y性染色体、同源四倍体甘蔗基因组的分型组装。并利用这些分型组装的基因组，探讨了基因组演化、性染色体演化和性别决定以及高杂合植物应对遗传负荷的机制等生物学问题。
嘉宾简介：张兴坦，研究员，博士生导师。2015年毕业于重庆大学生命科学学院植物学专业。攻读博士期间于2013年-2014年在美国J. Craig Venter Institute研究所从事访问研究；2015年7月-2020年9月福建农林大学基因组与生物技术研究中心工作。2020年10月进入中国农业科学院深圳农业基因组所工作。从事复杂多倍体基因组组装和分型、植物功能基因组学研究等工作。近年来以第一或共同第一作者在Cell、Nature、Nature Genetics、Nature Plants、Nature Communications等国际学术期刊发表论文多篇。